কালীগঞ্জ উপজেলায় বিভিন্ন কর্মসূচী নিয়ে দেশী, বিদেশী এবং স্থানীয় পর্যায়ের প্রায় ২৫ টি  এনজিও উপেজলা প্রশাসেনর সাথে সমন্বয় করে তাদের কাযর্ক্রম পরিচালনা করছে । উল্লেখেযোগ্য এনজিওর রয়েছে...

১। ব্র্যাক

২। আশা

৩। গ্রামীন ব্যাংক

৪। সোনার বাংলা ফাউন্ডেশন

৫। গ্রামীন শক্তি

৬। সিসিডিপি

৭। হাঙ্গার ফ্রি ওয়ার্ল্ড

৮। পল্লী উন্নয়ন সংস্থা

৯। স্বনির্ভর বাংলাদেশ

১০। আর,আর,এফ

১১। সি,এস,এস

১২। সৃজনী বাংলাদেশ

১৩। টি,এম,এস,এস

১৪। ব্যুরো বাংলাদেশ

১৫। এইড

১৬। অনুশীলন সমাজ কল্যাণ সংস্থা।